Die Unterschiede in der Genealogie Christi, wie sie im Lukasevangelium und im Matthäusevangelium dargestellt sind, werfen einige Fragen auf. Der Hauptunterschied liegt in der Abstammung: Matthäus nennt Jakob als den Vater des verlobten Josephs, während Lukas Eli angibt. Auch bei den Vätern von Salathiel und Serubbabel gibt es Abweichungen; während Matthäus Salathiel als Sohn des Jechonja nennt, führt Lukas ihn als Sohn des Neria an. Darüber hinaus unterscheiden sich die Nachkommen von Zerubbabel: Bei Matthäus heißt Zerubbabels Sohn Abiud und bei Lukas Risaja.
Zudem wird Joseph bei Matthäus als Nachkomme Davids durch Salomo und bei Lukas durch Nathan dargestellt. Die Namen der Vorfahren unterscheiden sich von David bis Salathiel und von Serubbabel bis Joseph, und auch die Anzahl an Namen ist nicht identisch.
Eine mögliche Erklärung für diese Unterschiede könnte sein, dass Matthäus die Genealogie von Joseph dokumentiert, während Lukas die Linie der Jungfrau Maria aufzeigt, beide stammen jedoch von David ab, nur aus unterschiedlichen Zweigen. Die Darstellung von Genealogien in weiblicher Linie war damals nicht gebräuchlich, dennoch ist bekannt, dass auch Maria aus der Linie Davids stammt.
Eine andere Hypothese besagt, dass die Personen in beiden Stammbäumen identisch sind, allerdings unter verschiedenen Namen aufgeführt, was in jüdischer Tradition verbreitet war. Diese Annahme widerspricht jedoch den eindeutigen Hinweisen, dass die beiden Genealogien tatsächlich unterschiedliche Linien beschreiben.
Die plausibelste Erklärung für die Differenzen basiert auf dem Gesetz der Leviratsehe, das einen Verwandten dazu aufforderte, die Familie des kinderlosen Verstorbenen durch dessen Witwe fortzuführen. So hatte Salathiel, der von Matthäus als der Sohn des Jechonja behandelt wird, tatsächlich einen anderen Vater, den Neria, wie Lukas festhält.
Die genealogischen Linien der Nachkommen Salathiels unterscheiden sich ebenfalls: Matthäus verfolgt die Linie über Abiud, während Lukas sie über Risaja führt, was sich ebenfalls auf die unterschiedlichen Abstammungen von David über Salomo und Nathan zurückführen lässt. Folglich sind Jakob und Eli als Väter des verlobten Josephs zu identifizieren, wobei Joseph der leibliche Sohn Jakobs und nach dem Gesetz auch der Sohn Elis war.
Julius Africanus aus dem 2. Jahrhundert lieferte eine Erklärung für diese genealogischen Unterschiede, die auf Informationen von Verwandten der heiligen Jungfrau basierte. Diese Auffassung wurde von vielen Kirchenvätern und Theologen angenommen. Historisch waren solche Situationen, wie während der babylonischen Gefangenschaft, als das Haus David in der Politik nicht mehr präsent war, nicht selten.