Der Hauptunterschied ist wie folgt: 1) In der Matthäusgenealogie ist Jakob der Vater des verlobten Josefs (Mt 1,16), während in der Lukasgenealogie Eli als sein Vater genannt wird (Lk 3,23). 2) Beide Genealogien führen unterschiedliche Väter und Söhne von Salathiel und Serubbabel auf. Nach Matthäus ist Salathiel der Sohn des Jechonja (Mt 1,12), nach Lukas hingegen der Sohn des Neria (Lk 3,27). Zudem ist Zerubbabels Sohn nach Matthäus Abiud (Mt 1,13), während er in Lukas Risai ist (Lk 3,27). 3) Der verlobte Joseph wird laut Matthäus als Nachfahr Davids über Salomo verzeichnet (Mt 1,6 und 7), während in Lukas die Abstammung über Nathan erfolgt (Lk 3,31). 4) Die Namen der Vorfahren von David bis Salathiel (Mt 1,7-12; Lk 3,31-27) und von Serubbabel bis Joseph (Mt 1,13-16; Lk 3,27-23) sind in beiden Genealogien unterschiedlich, ebenso wie die Anzahl der Namen.
Die Erklärungen für diese Unterschiede lauten wie folgt: 1) Der Evangelist Matthäus dokumentiert die Abstammung von Joseph, während Lukas die von Maria darstellt, da beide von David abstammen, jedoch durch verschiedene Linien. Anders jedoch stehen die klaren Aussagen von Lukas, der ebenso die Abstammung von Joseph wiedergibt. Darüber hinaus war es unüblich, ein Stammbuch über die weibliche Linie zu führen, ungeachtet dessen, dass Maria ebenfalls aus Davids Linie stammt. 2) Es besteht die Annahme, dass die Personen in beiden Genealogien identisch sind, jedoch unterschiedliche Namen haben, was möglicherweise auf die jüdische Gepflogenheit zurückzuführen ist, einer Person mehrere Namen zu geben. Diese Hypothese steht jedoch im Widerspruch zu den klaren Hinweisen, dass die eine Linie von David über Salomo und die andere über Nathan führt, also von zwei verschiedenen Männern. Zudem unterscheiden sich die Anzahl der Mitglieder: Eine Genealogie weist mehr Namen auf (Lukas), die andere weniger (Matthäus). 3) Die plausibelste Erklärung für diese Diskrepanzen könnte auf dem Gesetz der Leviratsehe basieren, welches vorschreibt, dass der Bruder oder der nächste Verwandte eines kinderlosen Verstorbenen dessen Witwe heiratet, um die Linie fortzusetzen (siehe Anmerkung zu Matthäus 1,12). Die Kinder, die in diesem Zusammenhang geboren werden, gelten in gewisser Weise als Söhne von zwei Vätern – dem biologischen und dem nach dem Gesetz. Daher wird Salathiel von Matthäus als der Sohn des kinderlosen Jechonja genannt, während Lukas ihn als den Sohn des Neria bezeichnet, der die Abstammung des kinderlosen Jechonja wiederherstellte.
Serubbabel, adoptiert von Salathiel, hatte Abiud und Risai als Nachkommen. Matthäus verfolgt die Linie über Abiud, während Lukas sie über Risai fortführt. Auf diese Weise führt Matthäus die Abstammung bis Jakob zurück und Lukas bis Eli, die beide als Väter des verlobten Joseph genannt werden. Eli, Sohn Matthats, starb kinderlos, und Jakob, der nächste Verwandte, stellte durch seine Witwe die Linie wieder her und gebar Joseph, der somit nach dem Fleisch der Sohn Jakobs und nach dem Gesetz Elis war.
Diese Erklärung der genealogischen Unterschiede geht zurück auf den Schriftsteller Julius Africanus, der sie von den damals lebenden Verwandten der heiligen Jungfrau erfuhr (Euseb. Church Hist. 1, 7). Diese Ausführungen sind die wahrscheinlichsten und wurden von vielen Kirchenvätern und Theologen übernommen. Beispiele für die Anwendung des Leviratsgesetzes sind in Zeiten denkbar, in denen das Haus David in Gefahr war – während der babylonischen Gefangenschaft und vor dem Kommen Christi, als die Linie Davids nicht mehr in Jerusalem herrschte.