Er glaubte, dass er die erbitterte Wut seiner Widersacher besänftigen könnte, ohne zu extremen Maßnahmen greifen zu müssen. Daher entschied er, Christus zu geißeln, um nach dieser Bestrafung, die einen scheinbaren Kompromiss zwischen Gerechtigkeit und Barmherzigkeit darstellte, dem gesamten Geschehen ein Ende zu setzen. Pilatus erhob sich von der Gerichtsbank und zog sich in die inneren Räume des Palastes zurück. Nach altem Brauch war die Geißelung in der Regel der Auftakt zur Hinrichtung, worüber die versammelten Feinde Christi erfreut waren. Diese strenge Strafe konnte durch verschiedene Gesetze von römischen Bürgern nicht verhängt werden; jedoch erlitten all jene, die nicht das römische Bürgerrecht hatten, besonders in den unruhigen Provinzen, oft grausame Geißelungen. Christus wurde von den Soldaten ergriffen und unter dem aufgeregten Geschrei der Menge in den Hof des Prätoriums gebracht, wo die notwendigen Werkzeuge zur Bestrafung bereitlagen. Der zum Geißeln verurteilte Verurteilte wurde an einen Pfahl gebunden und mit speziellen Peitschen mit Widerhaken auf seinem bloßen Rücken ausgepeitscht, was seinen Körper in eine einzige blutige Wunde verwandelte. Es war nicht ungewöhnlich, dass die Geißelten rasch das Bewusstsein verloren und aus dieser Ohnmacht mit einem unvorstellbaren Gefühl des Leidens erwachten. Eine ähnliche Geißelung wurde später oft an christlichen Märtyrern während der Verfolgungen vorgenommen.
Eusebius von Cäsarea berichtet, dass die Anwesenden bei einer solchen Geißelung in Smyrna entsetzt waren, als sie sahen, wie der Rücken entblößt wurde und die Muskeln, Sehnen und gar die Eingeweide sichtbar wurden. Während die mosaische Gesetzgebung mit ihrem üblichen humanen Ansatz die Strafe auf eine bestimmte Anzahl von Schlägen beschränkte und besagte: "Vierzig Schläge darfst du geben und nicht mehr, damit dein Bruder nicht durch viele Schläge entstellt wird" (Deuteronomium 25,3), wurde dieses gesetzmäßige Prinzip in der damaligen Gesetzlosigkeit nicht beachtet. In diesem speziellen Fall wurde die Geißelung aufgrund eines Gerichtsurteils, also nach römischem Recht, vollzogen, das keine Obergrenze kannte. Da die Geißelung als ein Mittel zur Befragung galt, war in der Regel der Richter selbst anwesend und ermutigte die Henker in ihrer grausamen Aufgabe. Es ist anzunehmen, dass Pilatus von dieser schrecklichen Pflicht sich befreite und in die inneren Gemächer zurückkehrte, um sich zu beruhigen und die nächsten Schritte zu überdenken, möglicherweise auch, um mit seiner Frau Claudia zu sprechen, die aufgrund ihrer starken Anteilnahme am Schicksal des Gefangenen sicherlich ihre Gedanken über die Leiden, die sie im Traum erlebt hatte, und über ihre Verwirrung in Bezug auf den Gerechten mit ihm teilte.
Nachdem die Geißelung vollzogen war und der Gefangene "seinen Willen" (Lk 23,25) hatte, machten sich die ungehobelten Legionäre, die meist aus der ärmsten Bevölkerung rekrutiert wurden, sowie seine engsten Feinde, die sich nicht trauten, das Prätorium zu betreten, um sich nicht zu verunreinigen, jedoch das grausame Schauspiel der Geißelung miterleben wollten, über den Gefangenen lustig. Christus, der sich selbst als König bezeichnete, war daher ein Ziel ihrer Verspottung. Ein abgetragenes rotes Militärgewand wurde ihm über die Schultern geworfen, ein Schilfrohr als Zepter in die Hände gelegt und eine Dornenkrone auf sein Haupt gesetzt. Es war wahrscheinlich eine Dornenkrone aus dem nahegelegenen Nubkastrauch, der reichlich um die Stadtmauern Jerusalems wuchs. Zufrieden mit ihrer boshaften Kreativität verneigten sich die Henker höhnisch vor ihm und riefen: "Heil, König der Juden!"
Die Juden, die zerknirscht waren, reagierten mit verhöhnenden Ausrufen und begleiteten diese mit Schlägen auf den Kopf und dem Spucken ins Gesicht. Es bleibt ungewiss, wie lange diese Demütigung andauerte, doch all die Grausamkeiten und Spötteleien, die damit verbunden waren, konnten dem Herzen unseres Herrn keinen Seufzer entlocken. Der Leidende hätte um Gnade bitten oder seine Henker um Erbarmen anflehen können. Doch er schwieg, wohl wissend um seinen unendlichen Triumph und seine Überlegenheit. Im Garten Gethsemane litt er unter seinem eigenen seelischen Angespanntsein und rief zu seinem Vater im Himmel mit der Bitte, "dass dieser Kelch vorübergehe". Jetzt, während er bereits begann, den bitteren Kelch des Leidens zu trinken, zeigte er die innere Freude eines Siegers. Sein Schweigen war ein deutliches Zeichen seiner Hingabe an den Willen seines Vaters. Er vollbrachte sein Lebenswerk klaglos, in Übereinstimmung mit dem ewigen Plan des himmlischen Rates und aus Liebe zu seinem verlorenen Volk und der Welt. Für menschliche Augen war sein königlicher Geist von körperlichen Leiden und Nuttschwierigkeiten umhüllt; doch umso klarer war das triumphale Ende seines irdischen Lebens vor ihm sichtbar. Er näherte sich dem Tod, um den Tod und seine verderblichen Werke zu besiegen und als Lebensspender und Gründer der Kirche aufzuerstehen, die die Welt erlösen sollte.
Ein solcher triumphaler Sieg des leidenden Gottessohnes inmitten all der Qualen der Erniedrigung konnte den römischen Prokurator nicht kalt lassen. Denn da er selbst tief am Schicksal des Gefangenen interessiert war, musste er noch größere Ehrfurcht und Furcht vor Ihm verspüren, als er die Gelegenheit hatte, von seiner Frau Claudia die Ursache seiner innermenschlichen Verwirrung bezüglich des Gerechten zu erfahren. Deswegen war er nun mehr denn je bestrebt, das unschuldig Unterdrückte zu verteidigen. Doch wie sollte er das bewerkstelligen? Der Fall war auf formeller Ebene schon verloren. Bereits die Geißelung und die anschließenden Demütigungen nach römischem Verfahren waren Anzeichen dafür, dass der Angeklagte schuldig befunden wurde und die verdiente Strafe erhielt. In Matthäus 27 wird erklärt, dass Pilatus gemäß den römischen Gesetzen handelte, die verlangten, dass ein zum Tode Verurteilter zuerst gegeißelt werden sollte. So war es auch von den Legionären und der Versammlung der Juden verstanden worden und es war vergeblich, dass Pilatus legte sich Mühe, dieser Handlung eine erlösende Bedeutung zu verleihen. Nach dem Verlust des juristische Falles gab er jedoch nicht die Hoffnung auf, den unschuldig Verurteilten, den er für unschuldig hielt, zu retten.
Nachdem er sich beruhigt hatte, ging er erneut zurück und offenbarte mit Mut sein Freispruchsurteil: "Siehe, ich führe ihn zu euch hinaus, damit ihr wisst, dass ich keine Schuld an ihm finde" (Johannes 19,4). Diese Aussage hatten die Menschen nicht erwartet und kaum hatte sich die Menge von ihrer Überraschung erholt, trat Jesus hervor und trug eine Dornenkrone sowie ein Purpurkleid. Er war verwundet, und Blut lief über sein Gesicht, doch in seinen gütigen und verzeihenden Augen lag majestätische Ruhe, und seine gesamte Erscheinung und Bewegung strahlte königlichen Siegeswillen aus. Selbst ein steinernes Herz muss beim Anblick dieser demütigen Hoheit eines unschuldig leidenden Menschen erweicht sein, und Pilatus nutzte den Moment, um einfach menschliches Mitgefühl anzusprechen, indem er rief: "Seht, ein Mensch!" Aber die Feinde Christi hatten ein Herz, das härter war als Granit, und nachdem sie sich von ihrer zunächst verblüfften Reaktion erholt hatten, schrien und klatschten sie mit noch größerer Wut und forderten blutrünstig: "Kreuzige ihn!" Hätte Pilatus mehr Moral und Zivilcourage besessen, wäre die Sache damit erledigt gewesen. Da der Gefangene nach dem römischen Recht für unschuldig erklärt wurde, hätte Pilatus die Anklage der Majestätsbeleidigung für unbegründet erklären müssen. Doch es blieb nur, den Fall nach dem jüdischen Gesetz zu entscheiden, das, da es begrenzte Bestimmungen beinhaltete, in dieser Lage nicht für die Verurteilung eines Menschen zum Tode herangezogen werden konnte. Pilatus deutete durch seine Worte: "Nehmt ihn und kreuzigt ihn!" lediglich an, dass sie keine Befugnis hatten, über das Leben eines Menschen zu entscheiden. Es blieb nichts anderes übrig, als die Versammlung aufzulösen, doch Pilatus fehlte die Entschlossenheit, dies zu tun.
Als die Juden sahen, dass die erste Anklage der Majestätsbeleidigung, die sie am meisten erwartet hatten, nicht durchkam, wechselten sie mit erstaunlicher List zu einem anderen Grund und antworteten dem Prokurator: "Wenn du nach deinem römischen, heidnischen Gesetz keine Schuld an ihm findest, so haben wir unser eigenes Gesetz, und nach unserem Gesetz muss er sterben, weil er sich selbst zum Sohn Gottes gemacht hat" (Johannes 19,7). Diese letzte Aussage hatte auf Pilatus eine außergewöhnliche Wirkung. Als er sie hörte, war er tatsächlich erschüttert. "Filias Dei" – ja, alles spricht dafür, dass er mehr ist als ein Mensch. Es war nicht unbegründet, dass Claudia in ihrem Traum eine geheimnisvolle Warnung erhalten hatte. Wenn man ihm Unrecht tut, könnte man an Gottes selbst Unrecht tun. Pilatus war in gewaltigem Zwiespalt und rief Christus zurück in das Innere des Prätoriums, um ihn erneut zu befragen: "Woher kommst du?", fragte Pilatus, "bist du ein irdisches Wesen, oder bist du nicht vom Himmel, geheimnisvoller und furchtbarer Sohn Gottes?"
Als gebildeter Römer war Pilatus sowohl mit der römischen als auch mit der griechischen Literatur vertraut; sie waren durchdrungen von der Erwartung einer geheimnisvollen Erscheinung, die zur Erneuerung einer verfallenden Welt führen sollte. Selbst ernsthafte römische Geschichtsschreiber berichteten von einem weit verbreiteten Gerücht, dass ein außergewöhnlicher Mann in Judäa erscheinen würde, der die Welt erobern werde. Tacitus, Hist. 5:13; Suetonius, Vesp. p. 4. Pilatus, als Herrscher von Judäa, war dieses Gerücht sicherlich bekannt, denn es stellt eine akute Gefahr für die römische Herrschaft dar. Stand nicht vor ihm diese fleischgewordene Gottheit? Für Pilatus schien es, als hätte er den Kern des Problems berührt. Wenn tatsächlich ein Gott oder Halbgott vor ihm stand, der unter den Juden so grausam gelitten hatte, möge er sich offenbaren und dann könnte der Prokurator, gestützt auf die Dankbarkeit Gottes, den aufgebrachten jüdischen Pöbel besänftigen und ihm sogar zur Seite stehen, um die Welt zu erobern. Unbedingt erwartete Pilatus eine Antwort auf seine Frage, doch Jesus gab ihm keine Antwort, da sein Gedanke, der am Anfang korrekt war, letztlich auf politischem Boden endete. Mit der üblichen Gewandtheit abergläubischer Heiden überkam Pilatus’ ehrfürchtige Furcht eine wütende Verärgerung, und er rief leidenschaftlich: "Antwortest du mir nicht? Weißt du nicht, dass ich die Macht habe, dich zu kreuzigen und die Macht, dich freizulassen?" Welch erbärmliche Selbstüberschätzung! Wenn bereits die Auseinandersetzung mit der jüdischen Versammlung die totale Ohnmacht des Prokurators offenbarte, so war es noch blasphemischer, sich in seiner Anmaßung zu prüfen, während doch jede Autorität in Wahrheit von Gott ist. Christus erwiderte ihm: "Du hättest keine Macht über mich, wenn sie dir nicht von oben gegeben wäre; darum, wenn du eine Sünde begingst, weil du nicht den Mut aufbringst, die Gerechtigkeit zu verteidigen, so sündigst du umso mehr gegen den, der mich dir überliefert hat." Selbst in seiner tiefsten Erniedrigung durch diesen römischen Statthalter ist Christus unendlich barmherzig und mitfühlend und wird in diesem Moment zum Richter, vor dem der stolze Heide der Angeklagte ist, und offenbart ihm die ewige Wahrheit.