Eine noch besorgniserregendere Entwicklung war, dass sich jetzt sogar die Sadduzäer den Pharisäern anschlossen und versuchten, Christus in Konflikt mit den Behörden zu bringen. Die Sadduzäer, obwohl zahlenmäßig gering, hegten bedeutenden Einfluss in der höchsten jüdischen Aristokratie, hielten die Spitzenpositionen im jüdischen Staat und waren die Hüter des Gesetzes. Sie gehörten der priesterlichen Klasse an und nahmen die höchsten Ämter innerhalb der jüdischen Hierarchie ein. Ihr Name könnte von der angesehenen Familie Sadok stammen, deren Nachkommen das Vorrecht hatten, im Heiligtum zu dienen (Hesekiel 40,46). Der berühmte Priester Jesus, ein Mitarbeiter von Serubbabel, stammte ebenfalls aus dieser Linie, die anscheinend sowohl nach ihrer Rückkehr aus der Gefangenschaft als auch davor eine Führungsrolle unter den anderen priesterlichen Häusern innehatte.
Zur Zeit von Josephus Flavius und den Aposteln hatten die Sadduzäer nicht nur die höchsten Ämter im Tempel inne, sondern waren auch durch unbescholtenes jüdisches Erbe gekennzeichnet (Ant. 18:3, 4). Diese priesterliche Aristokratie zeigte jedoch wenig Eifer für das Heiligtum, das ihrer Ehre und ihrem Wohlstand zugrunde lag. Ihre Vorfahren umfassten sowohl Hohepriester wie Jesus und Simon „den Gerechten“ als auch Verräter wie Manasse, Menelaos und Onias. Manasse erhielt von Sanballat die Genehmigung, einen Konkurrenztempel in Sichem zu errichten. Menelaos war ein Befürworter der griechischen Sitten und ein Freund der syrischen Herrscher. Onias baute in ähnlicher Konkurrenz einen Tempel in Ägypten. Bereits zur Zeit von Esra und Nehemia gab es Vorwürfe gegen die höchsten Würdenträger, die ersten zu sein, die gegen die theokratischen Gesetze verstießen, und einige beabsichtigten sogar, Teile des Tempels in private Wohnstätten umzuwandeln (1 Esra 9,2; Nehemia 13,7). Sie erniedrigten ihr Amt, um die Gunst der Ptolemäer und syrischen Könige zu gewinnen, und zogen sich, angesteckt von griechischem Halbwissen und Skeptizismus, aus dem bedeutenden Makkabäerkampf zurück. Um Herodes zu gefällig zu sein, gestatteten sie dessen Schwiegervater Simon Boethus von Alexandria, die hohepriesterliche Würde zu tragen, die dem frommen Juden Jesus, dem Sohn des Fabius, entzogen worden war. Sie zeigten sich auch unterwürfig gegenüber dem heidnischen Rom, was das Volk, angeführt von den Pharisäern, nicht vergaß. Diese unter den Pharisäern entstandene Feindschaft und das Misstrauen gegenüber der Priesteraristokratie waren weit verbreitet, und die Pharisäer sahen sich gezwungen, zahlreiche Zugeständnisse zugunsten ihrer Regeln zu machen.
Der Kluft zwischen den fanatisch strengen Synagogenvorstehern und der anspruchsvollen Tempelaristokratie wurde zusätzlich vertieft durch die Bestrebungen der Pharisäer nach der Wiederherstellung der Theokratie, ein Zustand, dessen Umsetzung von der bestehenden priesterlichen Ordnung abhängt, die unter der Leitung der gleichgültigen Sadduzäer lag. Diese politische Rivalität wurde durch die unterschiedlichen religiösen Überzeugungen beider Seiten weiter angeheizt. Die Sadduzäer lehnten es ab, ihre Aufgaben von den Rabbinern der Dorfsynagogen zu lernen, und wiesen den gesamten Kodex der pharisäischen Traditionen zurück; einzig das geschriebene Gesetz des Mose galt für sie, obwohl sie auch einige ihrer eigenen Traditionen hinzufügten. Durch ihren Status in der höchsten Priesterschaft und ihre Abstammung von den ehrwürdigen Familien, die einst im Tempel Salomos dienten, fühlten sie sich erniedrigt, wenn sie sich an die Pharisäer wandten, um über das Gesetz und die Lebensweise Israels zu lernen. Sie verachteten die Feinheiten des pharisäischen Legalismus. Während die Sadduzäer auf den buchstäblichen Gehalt der Gesetze beharrten, legten die Pharisäer diese dem Zeitgeist entsprechend milder aus. Die verschiedenen Ansichten über das Gesetz führten zu scharfen Streitigkeiten zwischen den beiden Gruppen.
Die Pharisäer, die die Nachkommen jener Helden waren, die das Volk in der großen Auseinandersetzung mit Syrien von der Unterdrückung befreiten, warteten geduldig auf die Verheißungen aus den Prophezeiungen Daniels. Sie glaubten, dass Israel unter dem Haupt des Messias eine neue Ära begründen würde, in der Herrschaft und Herrlichkeit erlangen würde, wie es in Daniel 7,14 prophezeit wurde. Sie waren überzeugt, dass dieser nationale Sieg eintritt, sobald Israel die zermonialen Gesetze mit äußerster Präzision erfüllte. Für sie waren die Tugenden, die sie forderten, notwendig und die Vollziehung ihrer Rituale war essenziell, um Gottes Verheißung zu erhalten. Ihr Eifer war also mehr ein Dienst als aufrichtige Frömmigkeit, und die Mechanik ihrer Rituale zeugte davon. Die Sadduzäer ironisierten diese Ideale als veraltet und uninteressant, verehrten stattdessen das gegenwärtige Leben und verhöhnten die messianische Hoffnung der Pharisäer. Sie waren der Auffassung, dass die Seele mit dem Körper vergeht und die Vorsehung nicht existiert, und sie beanspruchten, dass alles vom menschlichen Handeln abhängt, ohne dass eine göttliche Intervention nötig sei (Ant. 18:1, 4). Sie hatten kein Interesse an einer Erneuerung, da sie die bestehenden ihrem Wohlstand zugrunde liegenden Verhältnisse schätzten.
Trotz ihrer gesellschaftlichen Stellung genossen die Sadduzäer nicht die Unterstützung der Bevölkerung, die sich an die Pharisäer wendete, die als die wahren Hüter des Volkes galten. Der Unmut über die Sadduzäer, die alle Regierungsformen unterstützten, sowie die patriotische und religiöse Abneigung der Pharisäer gegenüber der römischen Herrschaft machten die Situation problematisch. Infolgedessen hatte der Einfluss der Pharisäer in religiösen Belangen solch ein Gewicht, dass nichts ohne deren Zustimmung getan werden konnte, was sich auch auf die Gottesdienste und Opfer niederschlug. Dennoch gab es viele Priester, die nicht den Sadduzäern angehörten, sondern in Demut und Reinheit Gottes dienten, und viele von ihnen schlossen sich noch nach dem Tod Christi dem Glauben an. In der Geschichte, die sich zwischen den Sadduzäern und Pharisäern entspann, schlossen sich die zuvor so verfeindeten Gruppen zusammen, um gegen ihren gemeinsamen Gegner, Christus, zu kämpfen. Sie waren unfähig, die Zeichen wahrzunehmen, die er tat, um seine göttliche Sendung zu beweisen. Sie forderten von ihm übernatürliche Beweise, die demonstrierten, dass er der Gesandte Gottes war. Immer wieder hatten sie gehört, dass er als der Sohn Gottes bezeichnet wurde, doch sie könnten den Zeichen nicht trauen, da sie in der Annahme lebten, dass solche Wunder nur durch satanische Kräfte ermöglicht wurden, um das Volk zu verführen.
Die Pharisäer, die den Glauben an die Vorsehung betonen, waren für das Volk von großer Bedeutung. Im Gegensatz dazu sahen die Sadduzäer die menschlichen Geschicke als vom Menschen selbst abhängige Angelegenheiten an, ohne göttliche Einwirkung (Ant. 13:5, 9). Selbstverständlich fand das Volk in der Pharisäerseelsorge einen Bezug zu ihrer eigenen spirituellen Suche und Hingabe, was den Pharisäern Ansehen und Respekt brachte, während die Sadduzäer als distanziert und unerreichbar wahrgenommen wurden.